Действие фильма разворачивается спустя два года после событий игры Final Fantasy VII. Планета стала довольно мирным местом, хотя города и вся индустрия полностью разрушены, а большая часть населения заражена синдромом "Звездного шрама". Главный герой по имени Клауд живет один и чувствует вину за то, что совершил, спасая мир. Но покой герою только снится - жителей планеты начинает поражать странная болезнь, а в окрестностях появляется таинственный незнакомец по имени Кададжи, явно замышляющий дурное. И его недобрые планы как-то связаны с беззащитными сиротами. Поняв, что зло вновь пробудилось, Клауд снова берет в руки оружие, чтобы защитить мир от новой угрозы...
Это Compleate Edition - добавлено полчаса дополнительных сцен, часть сцен были переделаны. Сюжет стал более цельным и понятным.